工業工控主板與商用主板區別的主要表現在以下幾點方面：

    1.商用主板使用普通的電解電容，主要為降低主板的成本考慮。
    2.工業工控主板元器件：主板的元器件需要適應寬溫環境（-20℃~60℃），保證在惡劣環境下（壽命期內永久開機、氣候惡劣、潮濕、振動、多塵、輻射、高溫等等）正常工作；主板元器件需要耐高溫、抗潮濕等等。高質量的貼片式的電解、鉭、陶瓷電容。
    3.工業工控主板的PCB ：商用主板采用的是4層PCB設計，一般的PCB線路板分有四層，最上和最下的兩層是信號層，中間兩層是接地層和電源層，將接地和電源層放在中間。工業主板采用的是6層以上PCB線路板設計，其設計是為了加強主板的抗電磁干擾、電磁兼容能力，增強主板的穩定性等等。
    4.CPU ：工業工控主板一般選用的是低功耗的CPU，以便適應工控行業惡劣的環境應用 AtomN230\270\330\N450D525.將南北橋部分功能整合在處理器上的CPU。
    5.抗電磁波干擾能力不同 ：對抗電磁波干擾能力要求較高，需要通過EMI、EMC等測試和認證。這需要從兩個方面考慮，一是從主板的線路布局設計上考慮，二是從選料和結構、電源、接地情況上考慮。
    6.支持更多接口 ：同時可以支持Mini PCI-E、PC 104+ 、多COM口接口，內嵌GPIO總線，雙顯示功能帶LVDS、HDMI、DVI接口，全場卡能與底板配合更具擴展性支持多個ISA、PCI、MINIPCI擴展。
    7.使用環境：工業工控主板常在惡劣環境下工作溫度范圍可達-20度~70度 （壽命期內永久開機、氣候惡劣、潮濕、振動、多塵、輻射、高溫等等），而這些環境下是商用主板無法勝任。
    8.保護功能：工業工控主板通過特殊設計，在遇到死機等異常情況，可以實現看門狗自動重新啟動、防浪涌沖擊等功能，全力的保證系統在惡劣環境的高穩定性的要求 。